Eén van de grote verschillen tussen Server Based Computing en Desktop Virtualisatie is het feit dat lang niet alle applicaties voor SBC geschikt zijn. Bij SBC wordt namelijk het operating systeem op de server gedeeld door de gebruikers, terwijl bij desktop virtualisatie elke gebruiker haar eigen (virtuele) operating systeem omgeving heeft. Het is daarom nodig om elke applicatie grondig te testen bij de overweging om deze in een SBC omgeving in te zetten. Op VanBragt.net is daarvoor zojuist een handleiding geplaatst in de vorm van een stappenplan.